【空路】
プノンペンポチェントン国際空港への日本からの直行便はないため、シェムリアップ、あるいはバンコク、ホーチミンなどの周辺国の空港を経由して入国することになる。所要時間は、シェムリアップからは約45分、バンコクからは約1時間15分、ホーチミンからは約50分。
プノンペンポチェントン国際空港から市街地まで約10キロメートル。エアポートタクシーで所要時間は約10分。

【水路】
シェムリアップからトンレサップ湖とトンレサップ川を走るボートもある。プノンペンには日本友好橋の北側にある乗り場につく。所要時間は季節による水量にも影響し約4〜5時間。

【陸路】
セントラルマーケットの南側にバス乗り場があり、シェムリアップ、シアヌークビル、バッタンバンとの高速バスに乗れる。また乗り合いタクシー（ピックアップトラック）もある。